最近的幾年間，國內本科畢業生希望以讀研為目的赴日本留學的人數有明顯增加，但由于日本大學院教育是以導師制為特色，使得同學們在申請中碰到許多特別的困擾，現就工作所得，討論如下：
1、關鍵詞匯
為便于同學們聯系實際，所以本文遇到中、日詞匯字形重復，但意思不同時，會選用日本方的意思。為避免誤會，首先澄清幾個中、日兩國都用，但意思不同，卻與到日本讀研有關的重要詞匯，以便同學們閱讀。
(1)大學生院：即中國或歐美所說的研究生院，是學生進行碩士或博士課程學習并取得學位的學習機構；
(2)研究生：是在日本入讀正式碩士或博士課程前的預備學習階段。而中國概念的“研究生”是指正式碩士或博士課程；
(3)大學院生(簡稱院生)：即中國概念的“研究生”，在日本是指入讀正式碩士或博士課程者；
(4)別科：原意是高等教育機構開設的語言課程，但實際生活中往往成為私立大學擴大本科招生而開設的預科班，一般是以班級為單位，主要教學內容多是統一進行基礎日語的學習。因此，有人認為這可能是生源相對充足，招生壓力不大的日本國、公立大學幾乎不開設別科的原因之一。需要特別說明的是，研究生雖然也是預備學習階段，但是在自己申請的導師指導下為完善自己的專業知識和提高專業水平，利用旁聽部分專業課(多由導師指定)等方式單獨進行學習，從這一點來看，研究生階段和別科在實際中還是有很大區別的，還是不要混淆為好。
